MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Photorhabdus asymbiotica

Total Repeats: 84923

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012962	GTTT	2	8	198	205	0 %	75 %	25 %	0 %	253987484
2	NC_012962	AT	3	6	225	230	50 %	50 %	0 %	0 %	253987484
3	NC_012962	CAA	2	6	231	236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987484
4	NC_012962	TTG	2	6	247	252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
5	NC_012962	TTA	2	6	280	285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987484
6	NC_012962	GTT	2	6	340	345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
7	NC_012962	CAC	2	6	368	373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987484
8	NC_012962	ATA	2	6	401	406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987484
9	NC_012962	TTG	2	6	470	475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987484
10	NC_012962	TGG	2	6	561	566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987484
11	NC_012962	AGA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
12	NC_012962	GAT	2	6	751	756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987484
13	NC_012962	AAG	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
14	NC_012962	ATT	2	6	838	843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987484
15	NC_012962	AGA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
16	NC_012962	ACC	2	6	933	938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987484
17	NC_012962	A	6	6	970	975	100 %	0 %	0 %	0 %	253987484
18	NC_012962	CGA	2	6	978	983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987484
19	NC_012962	T	7	7	1014	1020	0 %	100 %	0 %	0 %	253987484
20	NC_012962	GCCAAT	2	12	1081	1092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	253987484
21	NC_012962	ATA	2	6	1178	1183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987484
22	NC_012962	AATGGC	2	12	1272	1283	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	253987484
23	NC_012962	TGG	2	6	1335	1340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987484
24	NC_012962	TGC	2	6	1358	1363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987484
25	NC_012962	AAC	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987484
26	NC_012962	GAA	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987484
27	NC_012962	TGGG	2	8	1518	1525	0 %	25 %	75 %	0 %	253987485
28	NC_012962	TAC	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987485
29	NC_012962	TAT	2	6	1581	1586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987485
30	NC_012962	GAAATG	2	12	1604	1615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	253987485
31	NC_012962	GAA	2	6	1646	1651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
32	NC_012962	TGA	2	6	1813	1818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987485
33	NC_012962	TGT	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987485
34	NC_012962	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
35	NC_012962	CGG	2	6	2080	2085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987485
36	NC_012962	ATTTT	2	10	2142	2151	20 %	80 %	0 %	0 %	253987485
37	NC_012962	TGG	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987485
38	NC_012962	CGC	2	6	2189	2194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987485
39	NC_012962	GAA	2	6	2203	2208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
40	NC_012962	TC	3	6	2272	2277	0 %	50 %	0 %	50 %	253987485
41	NC_012962	AAG	3	9	2352	2360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
42	NC_012962	GTTA	2	8	2378	2385	25 %	50 %	25 %	0 %	253987485
43	NC_012962	CTG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987485
44	NC_012962	AGA	2	6	2503	2508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987485
45	NC_012962	TTTA	2	8	2593	2600	25 %	75 %	0 %	0 %	253987486
46	NC_012962	TCAG	2	8	2743	2750	25 %	25 %	25 %	25 %	253987486
47	NC_012962	TGA	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987486
48	NC_012962	GAC	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987486
49	NC_012962	AAC	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
50	NC_012962	TGG	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987486
51	NC_012962	ATTG	2	8	2990	2997	25 %	50 %	25 %	0 %	253987486
52	NC_012962	GTT	2	6	3000	3005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987486
53	NC_012962	T	7	7	3023	3029	0 %	100 %	0 %	0 %	253987486
54	NC_012962	AAC	2	6	3060	3065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
55	NC_012962	GCA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987486
56	NC_012962	CAC	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987486
57	NC_012962	CAT	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987486
58	NC_012962	AG	3	6	3262	3267	50 %	0 %	50 %	0 %	253987486
59	NC_012962	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987486
60	NC_012962	TTG	2	6	3410	3415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987486
61	NC_012962	ACA	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987486
62	NC_012962	TGA	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987486
63	NC_012962	GCCG	2	8	3512	3519	0 %	0 %	50 %	50 %	253987486
64	NC_012962	CTC	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	253987487
65	NC_012962	CGA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
66	NC_012962	CTCTGT	2	12	3890	3901	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	253987487
67	NC_012962	GAT	2	6	3906	3911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
68	NC_012962	GAA	3	9	3939	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
69	NC_012962	CAG	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
70	NC_012962	TTA	2	6	3967	3972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
71	NC_012962	TGC	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
72	NC_012962	G	6	6	3989	3994	0 %	0 %	100 %	0 %	253987487
73	NC_012962	GAT	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
74	NC_012962	CGG	2	6	4025	4030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987487
75	NC_012962	TGT	2	6	4052	4057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987487
76	NC_012962	CCG	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987487
77	NC_012962	ACAG	2	8	4172	4179	50 %	0 %	25 %	25 %	253987487
78	NC_012962	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987487
79	NC_012962	TCCT	2	8	4272	4279	0 %	50 %	0 %	50 %	253987487
80	NC_012962	TTG	2	6	4363	4368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987487
81	NC_012962	TAAA	2	8	4375	4382	75 %	25 %	0 %	0 %	253987487
82	NC_012962	ATCC	2	8	4395	4402	25 %	25 %	0 %	50 %	253987487
83	NC_012962	CAATG	2	10	4453	4462	40 %	20 %	20 %	20 %	253987487
84	NC_012962	ACA	2	6	4594	4599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987487
85	NC_012962	TGA	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
86	NC_012962	TTCTC	2	10	4683	4692	0 %	60 %	0 %	40 %	253987487
87	NC_012962	TTC	2	6	4712	4717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
88	NC_012962	CTG	2	6	4729	4734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
89	NC_012962	TGA	2	6	4744	4749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
90	NC_012962	TGG	2	6	4759	4764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987487
91	NC_012962	CTG	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
92	NC_012962	ATG	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
93	NC_012962	GTC	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
94	NC_012962	TGC	2	6	4820	4825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
95	NC_012962	GCC	2	6	4839	4844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253987487
96	NC_012962	TCT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
97	NC_012962	TAT	3	9	5165	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
98	NC_012962	CGGATG	2	12	5179	5190	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253987487
99	NC_012962	CTT	2	6	5225	5230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987487
100	NC_012962	A	6	6	5301	5306	100 %	0 %	0 %	0 %	253987487
101	NC_012962	CT	3	6	5358	5363	0 %	50 %	0 %	50 %	253987487
102	NC_012962	CA	3	6	5400	5405	50 %	0 %	0 %	50 %	253987487
103	NC_012962	GAA	2	6	5459	5464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
104	NC_012962	ATC	2	6	5466	5471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987487
105	NC_012962	ATC	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987487
106	NC_012962	CTGA	2	8	5532	5539	25 %	25 %	25 %	25 %	253987487
107	NC_012962	CGA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
108	NC_012962	GCA	2	6	5620	5625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
109	NC_012962	CGG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987487
110	NC_012962	ACC	2	6	5749	5754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987487
111	NC_012962	GTG	2	6	5815	5820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987487
112	NC_012962	CGT	2	6	5880	5885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987487
113	NC_012962	GTCT	2	8	5887	5894	0 %	50 %	25 %	25 %	253987487
114	NC_012962	ATG	2	6	5973	5978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987487
115	NC_012962	ATT	2	6	6014	6019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987487
116	NC_012962	GAA	2	6	6066	6071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987487
117	NC_012962	AGC	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987487
118	NC_012962	CAG	2	6	7194	7199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987488
119	NC_012962	C	6	6	7200	7205	0 %	0 %	0 %	100 %	253987488
120	NC_012962	T	6	6	7411	7416	0 %	100 %	0 %	0 %	253987488
121	NC_012962	AC	3	6	7466	7471	50 %	0 %	0 %	50 %	253987488
122	NC_012962	ATT	2	6	7492	7497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987488
123	NC_012962	TTTC	2	8	7658	7665	0 %	75 %	0 %	25 %	253987488
124	NC_012962	C	6	6	7829	7834	0 %	0 %	0 %	100 %	253987488
125	NC_012962	ACC	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987488
126	NC_012962	TTA	2	6	7892	7897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987488
127	NC_012962	AAT	2	6	7936	7941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987488
128	NC_012962	ATC	2	6	7948	7953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987488
129	NC_012962	TAA	3	9	8055	8063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987488
130	NC_012962	GCTG	2	8	8135	8142	0 %	25 %	50 %	25 %	253987488
131	NC_012962	GAA	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987488
132	NC_012962	TCA	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987488
133	NC_012962	TTA	2	6	8268	8273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987488
134	NC_012962	CAC	2	6	8525	8530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987489
135	NC_012962	CAC	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987489
136	NC_012962	CTG	2	6	8646	8651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987489
137	NC_012962	AGC	2	6	8660	8665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987489
138	NC_012962	ATT	2	6	8767	8772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987490
139	NC_012962	ATC	2	6	8783	8788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987490
140	NC_012962	ACC	2	6	8822	8827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987490
141	NC_012962	TTGAA	2	10	8951	8960	40 %	40 %	20 %	0 %	253987490
142	NC_012962	T	6	6	8983	8988	0 %	100 %	0 %	0 %	253987490
143	NC_012962	TCA	2	6	9024	9029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987490
144	NC_012962	TGATTT	2	12	9080	9091	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	253987490
145	NC_012962	CCA	2	6	9157	9162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987490
146	NC_012962	CAGA	2	8	9184	9191	50 %	0 %	25 %	25 %	253987490
147	NC_012962	CTGA	2	8	9211	9218	25 %	25 %	25 %	25 %	253987490
148	NC_012962	GCTG	2	8	9251	9258	0 %	25 %	50 %	25 %	253987490
149	NC_012962	AATA	2	8	9278	9285	75 %	25 %	0 %	0 %	253987490
150	NC_012962	T	6	6	9297	9302	0 %	100 %	0 %	0 %	253987490
151	NC_012962	TAA	2	6	9382	9387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253987490
152	NC_012962	CGG	2	6	9415	9420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987490
153	NC_012962	GGC	2	6	9434	9439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253987490
154	NC_012962	TGA	2	6	9471	9476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987490
155	NC_012962	GA	3	6	9500	9505	50 %	0 %	50 %	0 %	253987490
156	NC_012962	CAT	2	6	9673	9678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987490
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158	NC_012962	AGA	2	6	9786	9791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253987490
159	NC_012962	CAT	2	6	9836	9841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987490
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162	NC_012962	TCT	2	6	10011	10016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253987491
163	NC_012962	GGT	2	6	10120	10125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987491
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165	NC_012962	CTG	2	6	10234	10239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253987491
166	NC_012962	CAT	2	6	10300	10305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987491
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169	NC_012962	TGG	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987492
170	NC_012962	GCA	2	6	10591	10596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253987492
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174	NC_012962	TTA	2	6	10753	10758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987492
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201	NC_012962	TACCG	2	10	12177	12186	20 %	20 %	20 %	40 %	253987492
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220	NC_012962	CAC	2	6	13260	13265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987493
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246	NC_012962	CAA	2	6	14993	14998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987495
247	NC_012962	ATG	2	6	15060	15065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987495
248	NC_012962	TTGGT	2	10	15492	15501	0 %	60 %	40 %	0 %	253987496
249	NC_012962	TAT	2	6	15508	15513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987496
250	NC_012962	AC	3	6	15516	15521	50 %	0 %	0 %	50 %	253987496
251	NC_012962	GTT	2	6	15539	15544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987496
252	NC_012962	TAC	2	6	15586	15591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987496
253	NC_012962	AT	3	6	15598	15603	50 %	50 %	0 %	0 %	253987496
254	NC_012962	TGA	2	6	15604	15609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253987496
255	NC_012962	GGT	2	6	15662	15667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987496
256	NC_012962	AT	3	6	15735	15740	50 %	50 %	0 %	0 %	253987496
257	NC_012962	ACC	2	6	15758	15763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253987496
258	NC_012962	GGGTG	2	10	15794	15803	0 %	20 %	80 %	0 %	253987496
259	NC_012962	TGG	2	6	15811	15816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253987496
260	NC_012962	TAT	2	6	15827	15832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987496
261	NC_012962	GATGG	2	10	16018	16027	20 %	20 %	60 %	0 %	253987496
262	NC_012962	ATT	2	6	16139	16144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	253987497
263	NC_012962	TAC	2	6	16203	16208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987497
264	NC_012962	CAA	2	6	16227	16232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253987497
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266	NC_012962	TCA	2	6	16294	16299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987497
267	NC_012962	GTT	3	9	16322	16330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987497
268	NC_012962	GTT	2	6	16415	16420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253987497
269	NC_012962	TTTC	2	8	16460	16467	0 %	75 %	0 %	25 %	253987497
270	NC_012962	TG	3	6	16480	16485	0 %	50 %	50 %	0 %	253987497
271	NC_012962	GCCA	2	8	16523	16530	25 %	0 %	25 %	50 %	253987497
272	NC_012962	GGCA	2	8	16547	16554	25 %	0 %	50 %	25 %	253987497
273	NC_012962	TCA	2	6	16630	16635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253987497
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296	NC_012962	TTGG	2	8	18163	18170	0 %	50 %	50 %	0 %	253987499
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